Untuk mewujudkan visi besar di atas, madrasah menerapkan beberapa misi utama:

1. Meningkatkan mutu pembelajaran yang inovatif dan berpusat pada peserta didik.
2. Mengembangkan budaya religius, moderasi beragama, dan karakter mulia.
3. Meningkatkan prestasi akademik dan nonakademik di tingkat provinsi dan nasional.
4. Mengembangkan Madrasah digital yang efektif dan modern.
5. Meningkatkan kompetensi guru dan tenaga kependidikan secara berkelanjutan.
6. Membangun kemitraan strategis dengan perguruan tinggi, dunia usaha, dan masyarakat.